汉中职业技术学院农林技术与生物工程学院领导班子由党总支书记、院长和副院长组成，统筹学院全面工作及教学科研事务。

学院设立综合办公室、学生管理办公室和农场开发管理办公室三个职能部门。综合办公室负责教学管理、日常行政与后勤保障；学生管理办公室负责学生思想政治教育及日常事务管理；农场开发管理办公室负责学院农场的规划管理。

学院设置畜牧兽医教研室、园林技术教研室和食品生物教研室，分别承担相关专业的课程教学、实训指导和人才培养任务。